近日，深圳承啟生物科技有限公司利用自主研發(fā)的云平臺(tái)Chi-Cloud及高精度算法FANSe3，實(shí)現(xiàn)了單機(jī)5分鐘分析完成一個(gè)全基因組數(shù)據(jù)集。這使得基因檢測(cè)結(jié)果向“立等可取”、“又快又準(zhǔn)”邁進(jìn)了一大步，大力推進(jìn)了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的普及落地。

承啟生物團(tuán)隊(duì)拋開傳統(tǒng)算法的框架，自主研發(fā)了底層算法FANSe系列算法，這是目前國(guó)內(nèi)唯一規(guī)模化商用的全自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的高性能測(cè)序比對(duì)算法，其準(zhǔn)確度在各種實(shí)測(cè)中大幅度領(lǐng)先國(guó)外算法。2017年，承啟生物基于FANSe3開發(fā)的新一代私有云平臺(tái)Chi-Cloud，就實(shí)現(xiàn)了全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的秒級(jí)分析，并發(fā)表在英國(guó)著名的權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》上。2018年，承啟生物更是創(chuàng)下了“1分鐘解碼2萬(wàn)個(gè)基因信息（全外顯子組）”的世界紀(jì)錄。

更值得一提的是，達(dá)到這個(gè)速度，承啟生物并沒有動(dòng)用大型服務(wù)器，只是使用了一臺(tái)高端的家用電腦。所有運(yùn)算只使用CPU，無(wú)需任何GPU、FPGA等專用硬件加速。這意味著基因組測(cè)序基礎(chǔ)分析的成本已達(dá)到了幾乎忽略不計(jì)的程度。在對(duì)數(shù)據(jù)保密性有高要求的一些特殊領(lǐng)域（如軍事、公共安全、特定的醫(yī)療場(chǎng)景等），可直接采用這種單機(jī)分析的方式，而無(wú)需采購(gòu)和維護(hù)大型計(jì)算集群，無(wú)需連接到互聯(lián)網(wǎng)。自主研發(fā)、不依賴專用硬件的特性使得各種功能增加與改進(jìn)十分方便，可擴(kuò)展性強(qiáng)，且不會(huì)受制于特定硬件平臺(tái)，從根本上避免了芯片禁運(yùn)導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn)。同時(shí)，該云平臺(tái)兼容目前國(guó)內(nèi)外所有主流測(cè)序儀，并針對(duì)國(guó)產(chǎn)測(cè)序儀進(jìn)行了特別適配和優(yōu)化，有力地保障了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的國(guó)家安全。

超高速、低成本的分析及更精確的結(jié)果解讀，基因檢測(cè)即將迎來(lái)立等可取的廣泛應(yīng)用場(chǎng)景，也將對(duì)整個(gè)行業(yè)的發(fā)展提供有力支撐。對(duì)研究人員而言，可更高效地分析基因組數(shù)據(jù)，大力推動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)和疾病治療等領(lǐng)域加速發(fā)展。對(duì)百姓而言，以前緩慢昂貴的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)檢測(cè)將變得更快速、實(shí)惠，診斷和治療將更有效、便宜；尤其是情況危急的病患，快速準(zhǔn)確的基因組分析能在第一時(shí)間幫助醫(yī)生快速診斷和制定最佳治療方案，將拯救更多生命。

（美通社,2020年6月18日深圳）